Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms