Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms