Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms