Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FRMPD1Q5SYB0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms