Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM61Q5EBN2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms