Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms