Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DUSP28Q4G0W2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms