Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NTRK2Q16620 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NTRK2Q16620 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NTRK2Q16620 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NTRK2Q16620 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NTRK2Q16620 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NTRK2Q16620 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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