Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FXNQ16595 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FXNQ16595 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FXNQ16595 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms