Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms