Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SYPL1Q16563 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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