Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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RPE65Q16518 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RPE65Q16518 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RPE65Q16518 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RPE65Q16518 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RPE65Q16518 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPE65Q16518 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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