Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms