Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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