Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SHPRHQ149N8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPRHQ149N8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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