Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
COL19A1Q14993 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms