Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSC3Q14574 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms