Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CKAP5Q14008 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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