Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNC3Q14003 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms