Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H2Q13888 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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GTF2H2Q13888 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H2Q13888 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms