Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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