Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTAN1Q13813 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SPTAN1Q13813 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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