Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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