Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDAP1Q13442 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 RLN2-201ENST00000381627 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDAP1Q13442 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms