Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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