Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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ITGB3BPQ13352 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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