Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF1Q13077 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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