Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PTP4A2Q12974 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTP4A2Q12974 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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