Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRAF2Q12933 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms