Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRIN2AQ12879 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
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