Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAPQ12770 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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