Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms