Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNB2Q08289 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms