Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms