Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DEUP1Q05D60 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEUP1Q05D60 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms