Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RHDQ02161 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHDQ02161 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms