Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCN7AQ01118 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms