Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HBBP68871 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
HBBP68871 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms