Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SKP1P63208 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms