Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P63121 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms