Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SPCS3P61009 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SPCS3P61009 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SPCS3P61009 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SPCS3P61009 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SPCS3P61009 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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