Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms