Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GJA9P57773 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms