Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP107P57740 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP107P57740 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP107P57740 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP107P57740 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP107P57740 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP107P57740 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms