Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BACE1P56817 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BACE1P56817 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BACE1P56817 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BACE1P56817 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BACE1P56817 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BACE1P56817 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BACE1P56817 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms