Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP4P49662 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP4P49662 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP4P49662 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP4P49662 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP4P49662 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP4P49662 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP4P49662 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP4P49662 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP4P49662 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP4P49662 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP4P49662 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP4P49662 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP4P49662 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms