Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FNTBP49356 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNTBP49356 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms