Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRT6CP48668 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRT6CP48668 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms