Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ME1P48163 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ME1P48163 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ME1P48163 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ME1P48163 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms