Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms